Winogradsky column lab page!


File:Icons-flag-uk.png
Welcome to the Winogradsky column lab page! Students from the Departments of Biological Applications and Technology, University of Ioannina and Icthyology and Aquatic Environment, University of Thessaly, Greece and the Microbiology course, Faculty of Sciences, University of Cádiz, Spain, discuss their findings on Winogradsky columns they constructed!

If you want to add a post, please feel free to contact the blog administrators (Hera Karayanni, Sokratis Papaspyrou or Kostas Kormas)!



Καλωσορίσατε στη σελίδα των Winobloggers! Διαδικτυακός τόπος συνάντησης φοιτητών, φοιτητριών και διδασκόντων δύο Τμημάτων από την Ελλάδα: Tμήμα Βιολογικών Εφαρμογών και Τεχνολογιών, Παν/μιο Ιωαννίνων και Τμήμα Γεωπονίας, Ιχθυολογίας και Υδάτινου Περιβάλλοντος, Παν/μιο Θεσσαλίας και ενός από την Ισπανία: Σχολή Θετικών Επιστημών, Πανεπιστήμιο του Cadiz. Παρακολουθούμε, σχολιάζουμε, ρωτάμε, απαντάμε σχετικά με τα πειράματά μας, τις στήλες Winogradsky!


Bienvenidos a la pagina web de los Winobloggers! Aquí los estudiantes y profesores de dos departamentos griegos, el Departamento de Aplicaciones y Tecnologías Biológicas de la Universidad de Ioannina y el Departmento de Agricultura, Ictiología y Sistemas Acuáticos de la Universidad de Thessalia, junto con los estudiantes de Microbiología de la Facultad de Ciencias en la Universidad de Cádiz, se reúnen para observar, comentar, preguntar y responder a preguntas relacionadas con nuestro experimento, la columna Winogradsky.


Winogradksy columns

Winogradksy columns
'In the field of observation, chance only favors the prepared mind' Pasteur 1854

Blog posts

Thursday, 15 March 2012

Ομάδα Βόρκαπιτς-Δεδούση:






Στις φωτογραφίες μπορείτε να δείτε την  στήλη μας να χαλαρώνει μπροστά στην μπαλκονοπορτα απολαμβάνοντας το ήλιο. Για να αναπτυχθούν οι οργανισμοί του ιζήματος και του νερού τους προσφέραμε αυγό, εφημερίδα (και κονφετί που ήταν της εποχής) και corn flour. Και την αγάπη μας.
Προς το παρόν η στήλη μας δεν είναι ιδιαίτερα ακμαία, αλλά έχει εμφανίσει κάποια σημάδια αλλαγής. Η επιφάνεια μοιάζει κρεμώδης και έχει φουσκαλίτσες και άσπρες μουχλίτσες. Το νερό ολοένα και κιτρινίζει, ενώ εμφανίστηκε και ένα σκουρόχρωμο σχεδιάκι (το οποίο παρεπιπτόντως μου θυμιζει τον πίνακα Whistler's mother). Στην αρχή το πέρασα για μουχλίτσα, αλλά μετά από λίγο ψάξιμο μάλλον θα υποθέσω ότι είναι αναερόβιο βακτήριο.
Ευτυχώς δεν έχει αρχίζει ακόμα να ζέχνει..!!
Αυτά για τώρα. 

Wednesday, 7 March 2012

O Βόλος ξεκίνησε εχτές τις στήλες του, από την παραλία του Άναυρου.

kkormas

Wednesday, 15 February 2012

Tuesday, 14 February 2012

Στήλη winogradsky


Αρχικά συλλέξαμε λάσπη από την λίμνη παμβώτιδα, η οποία αναμίχθηκε με τα παρακάτω υλικά εμπλουτισμού:
Ø  1 αυγό
Ø  Φύλλα από εφημερίδα
Ø  Ξερά φύλλα δέντρου

Στην συνέχεια προσθέσαμε όλο το παραπάνω μίγμα μέχρι τα 2/3 της στήλης και το υπόλοιπο αυτής καλύφθηκε με νερό από την βρύση. Έπειτα η στήλη καλύφθηκε με διαφανή μεμβράνη και τοποθετήθηκε σε εσωτερικό χώρο σε σχετικά φωτεινό μέρος. Παρακάτω παρατίθενται κάποιες φωτογραφίες της στήλης: 
1η φωτογραφία
 







2η φωτογραφία










 3η φωτογραφία
4η φωτογραφία

Σε μικρό χρονικό διάστημα παρατηρήθηκε χρωματισμός του νερού βρύσης (πράσινο χρώμα), σχετική αύξηση της θολερότητάς του, φυσαλίδες και ύπαρξη χαρακτηριστικής  οσμής. Αυτά σημαίνουν την αξιοποίηση των θρεπτικών συστατικών που επιλέξαμε, άρα έχουμε ανάπτυξη των μικροοργανισμών.  Το χρώμα οφείλεται στην πιθανή αποσύνθεση  των οργανικών (αυγά-φύλλα) και στην συσσώρευση παραπροϊόντων του μεταβολισμού, ενώ η χαρακτηριστική μυρωδιά ίσως αποτελεί ένδειξη ύπαρξης υδρόθειου στη στήλη ή αναερόβιας ζύμωσης που πραγματοποιείται από τους αναερόβιους μικροοργανισμούς. Τέλος στο ίζημα δεν παρουσίαστηκε κάποια χρωματική αλλαγή.

Friday, 10 February 2012

Indoor Ecosystems

Τρομάζετε με τις στήλες σας...Αλήθεια τί συμβαίνει μέσα στα σπίτια σας;

Indoor Ecosystems
http://www.sciencemag.org/content/335/6069/648.summary

Thursday, 9 February 2012

Αναρωτιέστε ποιός είναι ο Winogradksy και δεν ξέρετε; Όλα όσα θέλετε να μάθετε γι' αυτόν θα τα βρείτε εδώ: Dworkin M (2012) Sergei Winogradsky: a founder of modern microbiology and the first microbial ecologist. FEMS Microbiology Reviews 36:364-379

KK

Wednesday, 1 February 2012

Καλησπέρα. Δεν έχω να πω κάτι καινούργιο για την "Στήλη", απλά μπήκα να ρίξω ένα βλέφαρο για κανένα θέμα.
Μια που την αναφέραμε όμως συνεχίζει στο δικό της βιολί και δεν έχουμε καμία αλλαγή, παραμόνο το ξέφρενο πάρτυ των μυκήτων. Δεν έχω κάποια πρόχειρη φωτογραφία της στο πορτοφόλι μου να σας δείξω οπότε για την ώρα θα πρέπει να με πιστέψετε ότι και αν σας λέω.

Tuesday, 31 January 2012


Η στήλη μου περιέχει ως πηγή εμπλουτισμού αυγό (πηγή θείου). Με την πάροδο του χρόνου έχει αποκτήσει ένα πολύ σκούρο καφέ χρώμα ενώ στην επιφάνεια υπάρχουν πολλές φυσαλίδες. Επίσης υπάρχει μία πιο σκούρη ζώνη μεταξύ ιζήματος και υπερκείμενου. Επιπλέον η οσμή είναι χαρακτηριστική.

Στήλη Winigradsky

Πειραματική πορεία που ακολουθήθηκε: Καταρχήν, πραγματοποιήθηκε συλλογή λάσπης από λίμνη Παμβώτιδα, όπου έγινε ανάμιξη αυτής με υλικά εμπλουτισμού τα οποία ήταν τα εξής:
  • ένα αυγό (ολόκληρο) το οποίο αποτέλεσε πηγή θείου
  • ξερά φύλλα δέντρου (πηγή κυτταρίνης)
  • κομματάκια χαρτιού(πηγή άνθρακα)
Στη συνέχεια, πραγματοποιήθηκε προσθήκη λάσπης μέχρι στα 2/३ της στήλης, και το υπόλοιπο έγινε προσθήκη νερού βρύσης। Η στήλη καλύφθηκε με διαφανείς μεμβράνη, και τοποθετήθηκε σε εξωτερικό χώρο σε σχετικά φωτεινό μέρος।

Υπόθεση του πειράματος μας ήταν να δούμε εάν θα υπάρξει ανάπτυξη μικροοργανισμών στη στήλη υπό τις συνθήκες που δημιουργήσαμε, δηλαδή πως θα επηρεάσουν την μικροργανισμική ανάπτυξη τα επιλεγμένα υλικά εμπλουτισμού, το είδος του νερού που προσθέσαμε, η παρουσία φωτός, και εάν ναι, τι είδους μικροοργανισμοί αναπτύχθηκαν Και επίσης, εάν είναι αναμενόμενα τα αποτελέσματα που θα λάβουμε.

Αποτελέσματα:
Καταρχήν, θα ήθελα να αναφέρω πως κατά την διάρκεια της όλης περιόδους παρατήρησης της στήλης, επικρατούσαν όχι σταθερές καιρικές συνθήκες, και αυτό είχε ως αποτέλεσμα εναλλαγές στην θερμοκρασία, καθώς επίσης και στον φωτισμό, γεγονός που πιθανότατα θα έχει επηρεάσει ως ένα βαθμό την ανάπτυξη των μικροοργανισμών στη στήλη। Λόγω των πολύ χαμηλών θερμοκρασιών που κατά καιρούς επικράτησαν, αυτό πιθανώς, θα προκάλεσε μείωση της ανάπτυξης των μικροοργανισμών λόγω του ότι αυτές οι θερμοκρασίες δεν είναι βέλτιστες για την ανάπτυξη αυτών.






Έντεκα ημέρας, μετά την διαξαγωγή του πειράματος
Παρατηρούμε αύξηση της θολερότητας, όχι σε πολύ μεγάλο βαθμό όμως।














28η

ημέρα

Παρατηρούμε ότι η στήλη του νερού έχει αποκτήσει ένα ελαφρύ καφέ χρώμα, γεγονός που δηλώνει την έναρξη της αποικοδομητικής δραστηριότητας των μικροοργανισμών.

Η οσμή της στήλης είναι δυσάρεστη, και αυτό ποθανόν οφείλεται στην αναερόβια ζύμωση που πραγματοποιείται στο ίζημα από τους αναερόβιους μικροοργανισμούς.










37η

ημέρα

Παρατηρούμε ότι η στήλη του νερού έχει αποκτήσει σκούρο μαύρο χρώμα, καθώς επίσης και το ίζημα, γεγονός που δηλώνει ότι υπάρχει πλήρης μικροοργανισμική δραστηριότητα στη στήλη του νερού και ότι επικρατούν αναερόβιες συνθήκες, πιθανόν αναπτύσσεται το Clostridium
το οποίο χρησιμοποιεί ως υπόστρωμα την κυτταρίνη, την οποία έιχαμε προσθέσει σαν υλικό εμπλουτισμού.
Ενώ στην επιφάνεια βλέπουμε μια λεπτή στρώση πράσινου χρώματος, που πιθανόν είναι κυανοβακτήρια (φωτοσυνθετικά βακτήρια)




46η

ημέρα

Παρατηρούμε ότι πλέον η στήλη του νερού έχει αποκτήσει ένα πορφυρό χρώμα, οπού και μπορούμε να συμπεράνουμε πως έχουν αναπτυχθεί πορφυρά μη-θειικά βακτήρια।
Το ίζημα παραμένει μαύρο।
Στην επιφάνεια επικρατεί ακόμη η πράσινη στρώση, οπότε συνεχίζουν την ανάπτυξή τους τα κυανοβακτήρια।






67η

ημέρα

Μετά από πολύ χαμηλές θερμοκρασίες για μεγάλο χρονικό διάστημα, σαν συνέπεια είχε την εικόνα που βλέπουμε!
Η τόσο χαμηλές θερμοκρασίες, πιθανόν προκάλεσαν αναστολή της κυτταρικής ανάπτυξης, και ίσως να επείλθε και θάνατος τον κυττάρων που ειχαν αναπτυχθει.










Αυτή είναι η εως τώρα εξέλιξη της στήλης!

Συμπερασματικά, με βάση την αρχική μας υπόθεση, μπορώ αν πω ότι παρόλο που κατά την χρονική διάρκεια του πειράματος υπήρξαν αρκετές διακυμάνσεις στην θερμοκρασία, και στον φωτισμό, και επίσης το ότι χρησιμοποίησα νερό βρύσης, τα αποτελέσματα ήταν ικανοποιητικά, διότι παρατηρήθηκε η αναμενόμενη μικροοργανισμική ανάπτυξη, εκτός των πορφυρών και πράσινων θειοβακτηρίων, που πιθανόν να οφείλεται στην χρήση του νερού βρύσης, έναντι του νερού της λίμνης.

Sunday, 29 January 2012

WINOGRANDSKY

 ΣΤΗΛΗ WINOGRADSKY



1)Κατασκευή
 
  Στα πλαίσια του μαθήματος Υδρόβιοι μικροοργανισμοί, στις 4 Νοεμβρίου 2011 πραγματοποιήθηκε παρασκευή της στήλης  Winogradsky. Πιο συγκεκριμένα, πήραμε μια άδεια φιάλη νερού και γεμίσαμε τα 2/3 αυτής με λάσπη-ίζημα από την λίμνη Παμβώτιδα. Αρχικά, διαβεβαιωθήκαμε ότι το υλικό πλήρωσής μας ήταν απαλλαγμένο από πέτρες, ξύλα και οτιδήποτε άλλο «φερτό» υλικό και στη συνέχεια το εμπλουτίσαμε με τις πηγές θρεπτικών που ο κάθε φοιτητής επέλεξε. Εδώ χρησιμοποιήσαμε ως πηγή θείου αυγό και ως πηγή άνθρακα φύλλα εφημερίδας και φύλλα δέντρων. Η «πλήρωση» της στήλης πραγματοποιήθηκε διαδοχικά και με προσοχή ώστε να απελευθερώνεται το οξυγόνο που φυλακίζονταν στα διάφορα επίπεδα λάσπης. Τέλος, το υπόλοιπο 1/3 καλύφθηκε με νερό βρύσης, κλείσαμε το στόμιο ώστε να μην ανανεώνεται από το περιβάλλον το διαθέσιμο οξυγόνο και η φιάλη τοποθετήθηκε στο μπαλκόνι έτσι ώστε να έχει πρόσβαση προς τον ήλιο.



2)Υπόθεση του πειράματος
  
 
  Επηρεάζει  η θερμοκρασία επώασης της στήλης την ανάπτυξη των μικροοργανισμών; Πώς το πόσιμο νερό μπορεί να επιδράσει σε αυτήν την ανάπτυξη:


3)Παρατηρήσεις και συζήτηση
    

Στο χρονικό σημείο μηδέν (0) δεν παρατηρείται καμία αλλοίωση ούτε στο νερό ούτε και στο ίζημα.

Μετά από 2 εβδομάδες από την έναρξη του πειράματος.


  Η διπλανή φωτογραφία αποτελεί μια πρώτη ένδειξη της εξέλιξης του πειράματος. Σχετικά σε μικρό χρονικό διάστημα παρατηρήθηκε χρωματισμός του νερού βρύσης (κόκκινο χρώμα), σχετική αύξηση της θολερότητάς του, φυσαλίδες και ύπαρξη χαρακτηριστικής, αρχικά ήπιας, οσμής. Τα γεγονότα αυτά σημαίνουν την αξιοποίηση των θρεπτικών που επιλέξαμε άρα ανάπτυξη των μικροοργανισμών και των αιωρούμενων σωματιδίων, το χρώμα οφείλεται στην αποσύνθεση πιθανώς των οργανικών (αυγά-φύλλα) και την συσσώρευση παραπροϊόντων του μεταβολισμού, ενώ η χαρακτηριστική μυρωδιά ίσως αποτελεί ένδειξη ύπαρξης υδρόθειου στη στήλη ή είναι αποτέλεσμα της αναερόβιας ζύμωσης που λαμβάνει χώρα από τους αναερόβιους μικροοργανισμούς. Το ίζημα δεν παρουσίαζε κάποια χρωματική αλλοίωση.
  




 Στο διάστημα που μεσολαβεί δεν παρατηρείται κάποια αξιοσημείωτη αλλαγή στη στήλη.
  






 





Μετά το πέρας του Ακαδημαϊκού εξαμήνου.
 
  Στο σημείο αυτό αξίζει να σημειωθεί ότι στα Γιάννενα αυτό το χρονικό διάστημα που μεσολάβησε σημειώθηκαν αρνητικές περιβαλλοντικές θερμοκρασίες γεγονός που λειτούργησε ανασταλτικά για τον πολλαπλασιασμό των όλων των μικροοργανισμών που αναμέναμε σύμφωνα με το ιδανικό. Επίσης το νερό στην επιφάνεια της στήλης πάγωσε και ίσως συνέβαλε και αυτό στην αναστολή της ανάπτυξης. Σε αυτήν την χρονική στιγμή παρατηρούμε αλλοιώσεις στο χρωματισμό του ιζήματος (κόκκινες και πράσινες περιοχές αντίστοιχα). Οι περιοχές αυτές αντανακλούν μια ικανοποιητική αύξηση του πληθυσμού των πορφυρών  θειοβακτηρίων. Η ανάπτυξη εκτιμάται πως είναι αποτέλεσμα του γεγονότος ότι στα κατώτερα βάθη της στήλης επιτελείται ανοξική αποικοδόμηση και αναγωγή των θειικών μια διαδικασία η οποία τροφοδοτεί με θείο τα ανώτερα στρώματα οπού συναντά κανείς τα θειοβακτήρια. Επίσης τα θειούχα άλατα που παράγονται από αναγωγείς του θείου συμβάλλουν και αυτά με την σειρά τους στην ανάπτυξη των πορφυρών και πράσινων θειοβακτηρίων.


Η οσμή της στήλης εξακολουθεί να είναι δυσάρεστη και εντονότερη σε σχέση με την προηγούμενη παρατήρησή μας με τη θολερότητα να σημειώνει χαρακτηριστική αύξηση.


 


4)Συμπεράσματα

  Γενικά γνωρίζουμε πως η διαβάθμιση και η διαθεσιμότητα των θρεπτικών αλλά και το βάθος στο οποίο μπορεί να διεισδύσει το φως έτσι όπως αυτό φαίνεται να συμβαίνει στη στήλη μας, αντικατοπτρίζει το τι συμβαίνει στη λίμνη. Οι διάφορες μικροβιακές  κοινότητες που βλέπουμε να αναπτύσσονται στη στήλη και ο τρόπος με τον οποίον κλιμακώνεται η ζωή σε αυτήν, αποτελεί ένδειξη της έκτασης που καταλαμβάνει ο κάθε οργανισμός, των θρεπτικών που αξιοποιεί του ρόλου που επιτελεί στο ίδιο το οικοσύστημα και τις σχέσεις που αναπτύσσει με τους άλλους οργανισμούς.
  Τα συμπεράσματά μας για το συγκεκριμένο πείραμα δεν μπορούν να κριθούν ως ασφαλή αφού μεταβάλλαμε αρκετές παραμέτρους του περιβάλλοντος της στήλης. Το νερό που χρησιμοποιήθηκε ήταν πόσιμο-τεχνικά επεξεργασμένο (χλωρίωση) γεγονός που ίσως επηρέασε σημαντικά το περιβάλλον ανάπτυξης των οργανισμών (επίδραση στο pH και τη χημική σύσταση του υδάτινου παράγοντα του μικρο-κλίμακας οικοσυστήματός μας)  και οι συνθήκες της επώασης του πειράματος ήταν ακραίες.
  Απαντώντας στα ερωτήματα που θέσαμε κατά την πειραματική υπόθεση, γνωρίζουμε πως σίγουρα η τιμές της θερμοκρασίας επώασης παρουσίαζαν μεγάλες διακυμάνσεις και άρα είμαστε σε θέση να πούμε πως γενικά η θερμοκρασία παίζει καθοριστικό ρόλο στην ανάπτυξη των μικροοργανισμών. Όσων αφορά το αν το νερό που χρησιμοποιήθηκε μπορεί και αυτό να συμβάλλει στην ανάπτυξη των μικροοργανισμών με τον οποιοδήποτε τρόπο, επιφυλακτικά (λόγο των όσων προαναφέρθηκαν)  θα μπορούσαμε να απαντήσουμε καταφατικά.